為了適應環境，深海魚的生理功能發生了很大的變化。這些變化反映在深海魚的肌肉和骨骼上。由於深海環境巨大的水壓，魚的骨頭變得很細；但也容易彎曲；肌肉組織變得特別柔韌，纖維組織變得出奇的細。更有趣的是，魚皮組織變成只有很薄的壹層，可以讓魚體內的生理組織充滿水分，保持內外壓力的平衡。這就是為什麽深海魚在這麽大的壓力下不會被壓死。
另外，深海魚的眼睛也變得很奇怪。我們常見的金魚不僅顏色很鮮艷，眼睛也很大，很好玩。與金魚相比，生活在深海中的魚的眼睛結構要比金魚豐富得多。壹般魚的眼睛大多長在頭的兩側，而生活在深海的魚的眼睛長在後腦勺。從正面看，魚的兩只大眼框就像兩個豎立的燈泡。從上到下，眼睛就像兩個大圓圈，占據了頭部的“堡壘”部分。更有趣的是，這種魚眼可以上下左右移動，眼球結構類似望遠鏡，還可以自由調節焦距。奇特的眼睛結構幾乎是深海魚的生理特征。
帶魚壹抓到就會“自殺”。帶魚是海中常見的魚類，脫水後很快就會死亡，所以很難見到活的帶魚。如果需要活帶魚的話，需要在漁船上準備壹個水缸，釣到之後馬上放進去，這樣就可以有活帶魚了，但是因為這種魚太常見了，所以漁民壹般不會這麽做。