納豆是由枯草芽孢桿菌納豆變種發酵而成的發酵食品。納豆營養價值豐富，含有豐富的蛋白質、多種氨基酸、維生素和礦物質。發酵後，營養更容易消化吸收。100g納豆相當於3個雞蛋或80g牛肉。
研究表明，納豆的保健功能主要與納豆激酶、納豆異黃酮、皂甙、維生素K2等多種功能因子有關。納豆富含皂甙元，可改善便秘、降血脂、預防大腸癌、降低膽固醇、軟化血管、預防高血壓和動脈硬化、抑制艾滋病病毒。納豆中含有遊離異黃酮和多種對人體有益的酶，如超氧化物歧化酶、過氧化氫酶、蛋白酶、澱粉酶、脂肪酶等。，可以清除體內的致癌物質，提高記憶力，保肝養顏，延緩衰老，提高食物的消化能力。攝入納豆芽孢桿菌活菌可調節腸道菌群平衡，預防痢疾、腸炎、便秘，其效果在某些方面優於常用的乳酸菌微生態制劑。納豆發酵產生的粘稠物質，包裹在胃腸粘膜表面，因此有保護胃腸道，減輕飲酒時醉酒的作用。
最新研究還表明，納豆對引起大規模食物中毒的“罪魁禍首”致病性大腸桿菌O157的發展有很強的抑制作用。這個新理論是由日本宮崎醫科大學的西山麗洋子教授發表的，他被稱為“納豆博士”。在“實驗室的實驗結果有限，但納豆能抑制大腸桿菌0157發展的原理尚未闡明”的前提下，楊航教授指出，納豆中含有的食用菌能阻礙許多菌株的繁殖，因此也應該抑制大腸桿菌0157。