七夕節有配藥的習俗。人們常以松柏為藥方，甚至主張松餌、取柏籽、折荷葉，並稱之為神仙藥。中醫認為，長期食用松子可以強心、潤膚、延年益壽；《玉姚博解》說它“潤肺止咳，潤腸通便，開關痹，滋養肌膚”，《海藥本草》說它“強身健體，延年益壽”；清宮也將松子列為禦膳。白子香氣濃郁，可養心安神、止汗潤腸；《本草綱目》中說，“所有的健脾藥都是幹的，而側柏葉可以通過潤藥來健脾，最好兩種健脾藥都用”。荷葉能清熱解暑，生發清陽，涼血止血。《滇南本草》說它能“清頭目風熱，止頭暈，化痰，止氣短，止嘔吐，止頭痛”。
在七夕上，常用壹些實用的方劑來治病。如將槐花汁曬幹治痔瘡，將槐花枝條切成小塊，煎至藥液呈綠色，先熏後洗痔瘡，具有清熱涼血、清肝瀉火的作用，療效較好；炒苦瓜可以治眼睛，苦瓜可以消暑清熱，可以治紅眼痛。《生生變》載“祛邪熱、解乏、清心明目”；采瓜提治瀉，瓜提在本經中列為上品，別錄曰“生時七月七日收”，“治瘧不求新久”。
七夕，閩西客家人習慣用仙人草和冬瓜塊加水熬煮，然後用幹凈的瓦罐密封保存，治療發燒、頭痛、中暑、驚風。這是有醫學依據的。本草求原說仙人草能“清熱解暑，清熱解毒臟腑，治酒風”，本草回春說冬瓜“去心火，瀉脾火，利濕祛風，消腫止渴，消暑解暑。”君子和石榴驅蟲防疫
相傳北宋景祐元年，閩南地區瘟疫流行，百姓因病面黃肌瘦。七夕那天，名醫吳坤提倡大家買菜做君子，買石榴驅蟲，很多人吃了之後效果顯著。吳坤後來被閩臺人民譽為“大道公”、“真正的神仙老師”，至今印象深刻。這也形成了壹種流傳至今的節日習俗。君子是有名的驅蟲劑。《本草綱目》說“味甘性溫，能殺蟲，益脾胃，故能克制虛熱，止瀉，為小兒病之藥”。石榴皮含有堿性物質，有驅蟲作用；果實營養豐富，能健胃、提神、增強食欲、延年益壽；石榴花有止血、石榴花泡洗眼、明目的作用。