中醫是壹種基於不同認識論的醫學。曾經，中國的人們常常喜歡以“國粹與民族”的名義為自己的觀點提供論據，而今天，反對者卻常常以“國粹與民族”的名義嘲諷那些維護傳統文化的人。就算人沒有什麽民族感情，很多被網友稱為“吐槽者”的人也只是用壹頂大帽子遮住了臉。似乎不挖他們的祖墳不足以顯示他們的高貴與開明。
中醫不是壹門人類知識分散不相關的科學，而是壹套有著緊密內在聯系和網絡系統的醫學。中醫和西醫壹樣，是壹套完整的醫學，具有“哲學認識論的基礎——基礎醫學理論——人類疾病的醫學理論——指導治療實踐和反饋改進——理論發展”的特點。
從認識論基礎上，可以找到中西醫最根本的區別。
中西醫都有基礎醫學。西醫是解剖學、生理學、生物化學等壹系列學科。中醫是《黃帝內經》。《黃帝內經》定義了人體，定義了中醫的基本術語和概念。中西醫都用臨床基礎學科，西醫是病理學、病理生理學、診斷學等學科，中醫是臟腑經絡理論、用藥習慣、氣血理論、溫病理論。
中醫和西醫都有藥理學，區別是對藥物的理解。壹種是陰陽學說衍生出的寒熱性質判斷，另壹種是基於不斷分解的化學單體。
中醫和臨床醫生與非臨床醫學的分工壹樣，也有養生為前端，康復為後端的理論。中醫和現代醫學體系的各個分支可以壹壹對應，中醫和西醫的關系是平行而不是附屬或分支，也不是對立的。
西醫對病人的治療和對醫生的培養有明顯的流水線科學特征，而中醫的培養只能是師徒制。中醫醫生之間的人際關系也不同於科學醫生之間的人際關系，中醫不會有西醫的回扣問題。
患者評價中醫水平的方法不同。
看西醫，我認為“壹流醫院、壹流醫院”湧向大城市的大三級醫院，是因為大醫院有資源集中的優勢。患者看中醫，會相信“中醫秘方”，會相信偏遠農村的壹個中醫。
中醫很難有嚴謹的邏輯證據。
因為陰陽的概念是模糊的，只能是思辨的，而不是精確的數理邏輯。科學的壹個重要特點是，所有的科學命題都必須有明確的檢驗標準，什麽時候、什麽地方、什麽條件都必須說清楚。中醫的基礎，無論是氣血學說、溫病學說還是經絡學說，都是不明確的，既不能證實，也不能證偽，更不能量化，不能組織，不能邏輯。所以中藥不可能準確，中藥的量是幾塊錢壹點，誤差在克的量級。西醫往往精確到毫克或微克。
中醫理論無法形成嚴密的數理邏輯體系，後果是:壹是自身難以深度整合，無法與現行科學體系融合；第二，知識不能模塊化。所以中醫必須回到《黃帝內經》的本源去辨證，而西醫會形成壹套以病理為基礎的規範化治療，這是科學的“積木”特征。比如勾股定理是“積木”，我們直接用勾股定理來確定壹條邊長，而不討論勾股定理為什麽是對的。這就是科學醫學的特點:直接用結論，不返本。
西醫明確疾病診斷後，用什麽藥，用量是明確的規範，不需要討論。因此，有了“模塊化”的理解方式，醫生經過短期培訓就有可能快速上崗，這是我國大量赤腳醫生承擔基層醫療任務的合理性。
很重要的壹點是，中醫不能模塊化。不模塊化意味著中成藥無效或者效用範圍很窄。在西醫中，用偉哥等化學藥物治療陽痿等某種疾病是可能的，因為在明確病理的基礎上，可以用科學方法做出壹系列嚴謹的證據。但是用壹個中成藥或者虎骨來治療陽痿是不可能做出科學的證據鏈的，因為中藥的化學成分太多，無法在細胞層面進行實驗。同樣，中藥註射劑也存在很多問題。如果是單壹的化學成分，還是可以研究的，而且化學成分很多，化學成分的比例濃度不是常數，怎麽統計分析？
二是整體論和還原論。西醫對人體的認識是不斷分解的。肉眼把人體分成各種系統和器官，把器官分成不同的組織，然後用光學顯微鏡把組織分成細胞，再用電子顯微鏡把細胞分成分子，然後用物理和化學的方法研究人體內分子和原子的反應。目前醫學科學的理論基礎和實驗基礎都在原子和分子水平。現在的物理理論已經進化到弦論，弦論中的“弦”類似於空，唯物主義強調物質是無限可分的。世界是精神的還是物質的，沒有公論。又是壹個巨大的話題，就不討論了。
聽聽另壹種聲音:最嚴謹的德國科學家說西醫是偽科學，中醫是科學。
滿晰博是德國漢學家、西醫學者、中醫學者。他幾乎和李約瑟齊名，精通東西方科學。李約瑟說，現有的科學不是過去科學的審判席，因為它的發展遠沒有結束！滿Xi駁斥西醫是偽科學，中醫是真科學。
滿士米隱約意識到中醫的科學性，當然是從自己的實踐中得來的。比如有壹年我在外面大冷天，肩膀疼得下飛機後胳膊都擡不起來。壹開始是用西藥治療，但是時間長了也沒什麽效果。後來改用艾灸，三次就完全康復了。1989年，他又患了膝關節炎。西醫先給他用了可的松，但是沒有效果。後來有人建議做手術，更換金屬關節。壹個姓周的中醫給我按摩，針灸，中藥。不到六個月，我就徹底治愈了。兩年前眼睛模糊，西醫說是中心性滲出性視網膜炎。沒有辦法治療，他可能會失明。學習時失明是最可怕的事。他用中醫藥方裏的浮屠丹和六味地黃丸作為基礎，做成粉末吃，幾個月就好了。現在73歲，視力1.5。
滿士米駁斥的是親身實踐和多年對中醫理論的研究，向全世界宣傳中醫。曾任德國慕尼黑大學東亞研究所所長，創辦國際中醫藥學會，開展專題研究，在世界各地舉辦多次學習班、報告會和學術交流。幾十年來，我努力工作，孜孜不倦。他的中醫著作有:中醫臨床藥理學、中醫方劑學、中醫針灸、中醫判斷、中藥學、中醫基礎理論。其中《中醫基礎理論》壹書風靡歐美，讓西方人對中醫有了新的認識。？
曼·Xi駁斥中醫在中國的發展。作為中醫的發源地，人們並沒有盡力推廣中國的傳統文化。相反，主流科學界急於擺脫然後迅速擺脫，使得中醫在中國持續衰落。雖然中醫在我國受到了國家有關部門的重視，但人們對中醫的科學原理認識不夠，甚至很多中醫對其持懷疑態度，這是中醫發展不起來的主要原因。
總之，中醫作為中華民族實踐經驗的壹部分，可以納入人文領域，研究其歷史文化意義，拓展中華民族的文化內涵。但在用於治療疾病時，還是以現代醫學為基礎的。中醫和西醫不是地理上對立的兩個詞。中醫屬於現代醫學之前的產物，現代醫學(西醫)是科學的產物，完全是兩種性質。在現代科學研究草藥的危害性和作用之前，慎用！