急性治療
在急性期的治療中，應爭取在4.5小時的黃金時間窗內進行溶栓治療，以降低腦代謝，控制腦水腫，保護腦細胞，挽救缺血半暗帶。急性處理主要如下:
吸氧和通氣支持糾正缺氧；
心電監護和心臟病的及時治療；
積極進行溶栓(4.5小時黃金時間窗內)和/或取栓，達到血管再通的目的；
抗血小板和抗凝治療；
積極控制感染和預防或糾正高熱，控制血壓和血糖，重視營養支持。
此外，當大面積腦血栓形成時，應在醫生仔細評估和明確適應癥後，盡早進行手術減壓，可降低死亡率和致殘率。
壹般療法
保持呼吸道通暢，安靜臥床；
定時翻身、拍背、吸痰，註意四肢的位置和排便的處理，防止褥瘡、肺炎、便秘和尿路感染，同時註意患者營養、水、電解質的平衡；
如果是風濕病、鉤端螺旋體病、梅毒等血管炎，要分別用抗風濕和青黴素治療；
積極治療原發病:針對原發病(如高血壓、糖尿病、冠心病等)制定切實可行的防治措施。)防止復發。如積極治療冠心病等心臟病，糾正心律失常。
藥物
藥物用於溶栓、抗凝、抗血小板、抗腦水腫，以保證患者身體的血液循環和微循環，防止血栓復發，保護神經細胞。患者可以在醫生的指導下使用以下藥物進行治療。
靜脈溶栓藥物
重組組織型纖溶酶原激活劑(RTPA):3小時內應用可有效提高治愈率。有顱內出血的風險。
尿激酶:能有效抑制血栓形成，但會增加出血風險。
抗血小板藥物
阿司匹林:可降低死亡率和致殘率，降低復發率。
氯吡格雷:聯合阿司匹林可降低復發風險。
這兩種藥物都會增加出血的風險。
抗凝血藥
肝素:可降低復發率。
阿加曲班:通過抑制凝血酶可以抑制血栓形成。
這兩種藥物也會增加出血的風險。
纖溶藥物
降纖酶:可改善神經功能，降低復發率，但會增加顱內外出血的風險。
巴曲酶:可降低死亡率和致殘率，但易導致出血。
控制血脂的藥物
他汀類:可改善預後，防止復發，但偶爾會發生橫紋肌溶解，導致腎功能衰竭。
改善微循環的藥物
丁苯酞:可改善缺血區的循環和神經功能缺損，其嚴重風險尚未監測到。
人尿激肽原酶能改善腦動脈循環。
外科療法
急診血管內手術
考慮到壹些影響因素，根據血栓的位置，部分患者可以通過在堵塞的血管內進行治療來治療腦血栓。
腦室減壓和引流
腦室減壓引流是將穿刺針或帶芯引流管插入腦室引流腦脊液，從而降低顱內壓的手術。對於顱內高壓嚴重的患者，經積極藥物治療後病情仍加重，特別是意識水平降低者，可考慮減壓。該手術可降低死亡率、致殘率，提高患者的生活自理率。