功效化濕行氣，溫胃止嘔，溫脾止瀉，溫腎下氣。
功效特點本品辛散溫通，芳香理氣，具溫而不燥、行氣而不破氣、調中而不傷中的特性，並能醒脾消食、開胃止嘔，專用於脾胃氣滯、脘腹脹痛、嘔吐瀉痢、不饑食少、食積不消等證，又能理氣安胎。
功效作用
1.化濕行氣：①用於濕阻中焦，癥見脘腹痞脹，惡心欲吐，口不渴，便溏尿濁，苔白膩，與茯苓、半夏、厚樸、枳實等同用。②用於脾胃氣滯，多因暴飲暴食致胃中氣機阻塞，癥見胃痛，脘腹脹滿，噯氣酸腐，吐出不消化之食物，可與木香、枳實等同用。
2.溫胃止嘔：①用於脾胃虛寒、胸痞嘔吐，可與木香、半夏、陳皮、茯苓、甘草生姜同用。②用於妊娠嘔吐，可單用本品1.5克至3克，研末沖服，或與茯苓、半夏、蘇梗等同用。
3.溫脾止瀉：用於脾虛寒濕積滯之瀉痢證，可與幹姜、附子、吳茱萸、肉豆蔻、訶子、木香、黃連同用。
4.溫中安胎：用於虛寒氣滯、胎動不安者，可與白術、桑寄生、川斷、杜仲等同用。胎動由於熱者不可用。
鑒別應用砂仁與白豆蔻，性味相同，功效相似，皆為芳香化濕、行氣寬中之品，惟白豆蔻芬芳清香、溫燥性較小，兼可宣通肺氣，用於胸悶不暢及中焦寒濕伏郁之輕證；砂仁則香氣濃郁，溫燥性較強，且功專於脾胃、腎，常用治寒濕凝滯、中焦阻塞較重之證，及妊娠惡阻胎動不安，並有溫腎下氣之功。
配伍應用
1.配白蔻仁：砂仁香竄而氣濁，散寒力較大，功專於中下二焦，暖胃燥濕，引氣歸元(腎)，適宜於寒濕積滯、寒瀉冷痢，又有安胎作用；白蔻仁芳香而氣清，溫燥之性較差，功專於上中二焦，和胃止嘔，適宜於濕濁阻胃之嘔噦、嘔逆，並能宣通肺氣。兩藥配用，宣通三焦氣機，芳香化濁，醒脾和胃，行氣止痛，俱能治濕濁內蘊、胃呆納少、氣滯胸悶、脘腹脹痛、反胃嘔吐等證。
2.配青、陳皮：砂仁辛香性溫，有醒脾和胃、行氣寬中之效；青皮性猛，偏於疏肝破氣、消積化滯；陳皮性緩，偏於健脾行氣、燥濕化痰。三藥合用，理氣止瀉，治脾胃氣滯、胸腹脹滿、消化不良及濕阻脾胃之泄瀉、痢疾。
3.配佩蘭：砂仁香濃氣濁，燥濕之性較強，有化濕醒脾，行氣寬中，安胎之效；佩蘭氣味芳香，功專清肺開胃，化濕悅脾，理氣之功為要。兩藥配用，芳香悅脾，可用治濕阻氣郁、惡心嘔吐、食欲不振、胸腹脹滿、胎動不安等證。
4.配冬葵子：冬葵子有催乳之功，另有滑腸作用，配砂仁行氣和胃，可增進食欲，加強營養吸收，故兩藥配用，有行氣下乳之效，可治乳少氣滯脹滿疼痛諸證。
5.配熟地：砂仁行氣調中，醒脾開胃，又助消化，並能引氣歸腎，兼有溫腎安胎作用；熟地補血生精，滋腎養肝，久服易膩嗡，宜用砂仁拌(或佐有少許砂仁)。兩藥配用，砂仁既免除熟地滋膩礙胃之弊，又可引熟地歸腎，此謂壹舉兩得。
6.配黃芩：砂仁與黃芩，二者性味功效迥異，然均有安胎之功。砂仁辛溫理氣之品，和氣機而安胎孕；黃芩苦寒清熱之品，降火涼血而安胎孕。二藥同用，寒溫相合，氣血配對，可使樞軸回旋，升降復取，熱泄氣和，而成安胎之妙用。
7.配木香：兩藥均是芳香辛散溫通之品，功效相同，皆有治療脾胃氣滯、食積不化之功，但砂仁偏於醒脾和胃，木香偏於調中宣滯，兩藥配用，治療脘腹氣滯脹痛、消化不良，以加強行氣止痛之功。
應用註意事項陰虛有熱者忌服。