1，顏色不同:紅鰭笛鯛為粉紅色或紅色，腹部較輕，側面無縱帶；紫紅笛鯛呈紅褐色，腹部略淺。
2.習性不同:紅鰭笛鯛棲息在有貝殼和沈積物的海域，或巖石、珊瑚礁附近水深不足80米的海域，而紅鰭笛鯛分布在印度洋和南太平洋，中國分布在南海和臺灣省南部海峽，無群體，隨季節變化進行短距離洄遊。