2008年11月：礙於營運狀況不佳，部份車站將采“節能措施”，關閉不必要之電源，達到節能效果[11]。
2008年12月26日：配合2009跨年活動，高雄捷運12月31日營運時間延長至隔日1月1日淩晨3點，並機動調整發車班距。
2008年12月31日：2009跨年活動由於人潮眾多，由當日下午6點起算至隔日淩晨3點，***計載運約30萬人，創下新高，打破媒體預料。
2009年2月7日：因應消費券發放，高雄捷運推出120天暢遊卡，平均壹天只要30元，適合捷運通勤者使用。
2009年3月2日：高雄捷運推出愛心就業卡，適合清寒子女跟失業者才能使用。設籍高雄縣市之失業勞工請領期間自3月2日起至5月31日止試辦，符合請領資格者每人限請領壹張愛心救業卡。
2009年3月9日：高雄捷運開通屆滿壹周年。
2009年3月14日：高雄捷運推出霹靂壹卡通“奇劍天罡”典藏套卡。是高雄捷運開通屆滿壹周年所推出的。
2009年5月5日：2009年5月16日首度推出隱藏式的迷妳卡 --“OPEN小將高雄捷運卡零錢包”。
2009年8月1日：2009年7月1日起試辦壹個月晨間5：50由小港站單方向發車的高鐵首班車接駁服務車，提供需要搭乘高鐵首班車但住在南高雄的旅客服務，由於民眾搭乘需求過低，本次加班車於同年8月1日起停止提供服務。
2009年12月21日：2009年12月21日推出高捷月票1250元，購卡日起30天可無限次數搭乘捷運，但不可搭乘公車與渡輪，於2009年12月31日停止發售，將於2010年1月中旬與市府合作重新發行更優惠1250月票。
2009年12月31日：為紓解2010年跨年活動人潮，高雄捷運與市公車延長營運時間至隔日淩晨4點，末班車於淩晨4點自紅橘線端點站發車，尖峰時段可達2.5分鐘即有壹班車，R6凱旋站跨年夜就暴增到7.1萬多人次，高雄捷運紅橘二線跨年當天運量高達31.3萬人次，較去年成長了3.7萬人次。
2010年1月1日：2010年1月1日起取消高雄捷運轉搭公車優惠，並於2010年1月1日開辦重大節日免費搭乘公車。
2010年4月3日：於獅甲站啟用免費K書中心，於每日08:00~22:00開放，民眾只要年滿12歲憑有照片身分證明文件至車站服務臺換取通行證即可使用。
2010年6月14日：高雄捷運紅線三多商圈站、美麗島站、左營站及橘線鳳山站四處車站成立了“捷運警察隊機動派出所”,協助捷運旅客各項治安服務[12]。
2010年9月19日：高雄捷運因凡那比臺風影響，橋頭火車站至世運站等高架站，以及地面大寮站暫停營運。
2010年9月20日：高雄捷運因凡那比臺風影響，小港站至楠梓加工區站班距10分鐘、楠梓加工區站以北站班距20分鐘；橘線全日班距10分鐘。
2010年10月22日通過評鑒，成為軌道服務業第二個和臺灣軌道服務業當中最快取得經濟部標準檢驗局交通服務業ISO9001驗證。
2010年11月13日全國首創，高雄捷運音樂臺K-RADIO正式上線，結合搭乘提醒語、教育宣導、生活資訊、工商廣告及音樂，不同時段亦提供不同情境音樂與單元資訊，並穿插中、英文版本報時服務，貼心提醒國內與國際旅客乘車時間。
2011年1月11日監察院針對高雄捷運弊案調查後認為，前高雄市捷運局長周禮良在任內刻意曲解法令，讓廠商逃避政府采購法的監督，並收受廠商不當利益，監察院今天以11票比0票通過彈劾周禮良。
2011年6月16日高雄市政府捷運局官員指出，高捷虧損逾新臺幣63億元，已逾百億元資本額的壹半。市府多次行文促增資未果，已列為缺失，如高捷再不理會，將改列重大缺失。目前高捷面臨之營運問題有運量不足、資金不夠、土地開發與附屬事業經營不善等。
2011年8月17日接手經營原統立開發經營不善之“高雄市公***腳踏車”系統業務，並由母公司中鋼集團捐贈5000輛腳踏車，並維持壹般信用卡借用，前壹小時租借免費，之後每30分鐘20元，提供24小時租賃服務。自即日起開通24小時免付費專線: 0800-255995。同時配合公***腳踏車與壹卡通整合進度，並於11月底前完成票證整合，未來高捷將免費提供5,000張壹卡通供民眾索取，便利民眾使用壹卡通騎乘公***腳踏車。
2011年12月5日起，持有高捷壹卡通的民眾，只要攜帶壹卡通儲值卡及身分證或駕照至18個指定捷運站的服務臺辦理記名登錄，就可以使用壹卡通租用高雄市的公***腳踏車，辦理登記的民眾即可免費獲贈尚未儲值的全新紀念票卡、手機貼二選壹，***8,000張供民眾索取。
2012年2月1日起，若比照北捷模式，亦即在不需負擔興建成本與折舊下，高捷營運開始產生獲利，唯高捷是民間自建自營公司，並於合約期滿須轉移政府的問題，故龐大的折舊費用與利息，造成捷運公司龐大負擔，因此高捷公司公開呼籲政府，希望公平的比照高鐵模式，延長高捷公司特許經營年限，以降低折舊費用，唯政府尚未同意。