劇情分集介紹：
第1集
明朝末年，號稱淑勒貝勒的努爾哈赤征服了建州五部，壹面打擊海西女真，壹面全力進攻東海野人女真。此時的努爾哈赤表面歸順大明，向萬歷皇帝朝貢，宣誓效忠，暗地裏卻厲兵秣馬，壯大勢力。
第2集
耿京士不負眾望取得比武大賽的勝利，他迫不及待想帶著賞金離開。努爾哈赤卻說自己是愛才之人，希望耿京士能夠歸順於他，耿京士斷然拒絕，稱自己來比武只為賞金而來。
第3集
戈振軍認定是耿京士殺害了何玉燕的父親，耿京士稱自己是被奸人所害，爭吵之間兩人打起來。何玉燕不相信耿京士會這樣做，認為這中間壹定是有什麽誤會。戈振軍不聽兩人的解釋，壹劍殺了耿京士。
第4集
常五娘被戈振軍拒絕，發誓要報復他，報復天下所有的男人。藍玉京想跟著藍水靈壹起回神農架參加女兒會，藍水靈說男孩不滿十八歲不能參加。藍水靈在女兒會上結識了外鄉人鄭巧兒。
第5集
藍玉京打傷了寨主的弟弟，寨主帶人登門興師問罪。無相罰藍玉京關禁閉窟三天三夜，寨主不同意，無相只好答應幫他的弟弟治傷，然後傳授給他武當劍法，他才肯罷休。
第6集
無相狠狠教訓了藍玉京壹頓，藍玉京連連向不聞賠禮道歉，不聞不能說話，可他用手語為藍玉京求情，無相還是決定懲罰藍玉京，藍玉京嚇得連連求饒，無相才肯饒過他。戈振軍罰藍玉京不許吃飯，還要在飯堂門前倒立到天黑。
第7集
無色和無量幫無相護法，無相強打精神為藍玉京療傷。戈振軍來到煉丹房，發現了闖入者留下的毛發，只是猜不到對方是誰。戈振軍回到住處，看到常五娘在這裏等候多時，常五娘逼他拿出紅丸，戈振軍只好承認紅丸被人調包，他拿到的是假的，常五娘卻不以為然。
第8集
戈振軍半夜做噩夢被嚇醒，正好看到常五娘來到藍玉京的房間，想要對熟睡中的藍玉京下手，戈振軍立刻上前阻止，把常五娘帶出房間。常五娘說藍玉京不能留，要趁著紅丸的藥性發作把他除掉。
第9集
長老懷疑是戈振軍給玉京下的毒，戈振軍無話反駁。藍玉京被逐出武當，不得踏進山門壹步。鄭巧兒被爺爺關禁閉紮馬步三天，聽說了藍玉京的事情後，她想去找藍玉京，但爺爺不肯放她出去。
第10集
玉京身體裏紅丸的藥效發作，壹直昏迷不醒。鄭巧兒和東方亮準備去找不岐道長的時候，不岐道長自己回來了。無量道長又來找不岐問他紅丸的事情，順便為玉京運功治療。
第11集
不岐主動要領教不波的太極劍法，不岐勝出，不岐認為此次公舉無量師祖是掌門的不二人選。牟滄浪帶領錦衣衛趕來，包圍了紫霄宮，隨即拿出聖旨宣布：武當須將全部武功典籍上交，武當弟子皆不可再繼續修煉武當武功，由朝廷指派的新任掌門牟滄浪執掌武當。
第12集
水靈和巧兒潛入藏經閣，根據字條的提示找到了武當最重要的武功典籍，壹直藏匿在藏經閣中的五娘和唐二搶走了武功典籍並放火要燒了藏經閣，此時，鄭鐵崗突然出現，救下了水靈和巧兒。
第13集
藍玉京與東方亮比試劍法，東方亮誇贊玉京武藝大有長進，玉京將武當七十二路奪命劍法送給東方亮。東方亮收到密信，決定與藍玉京暫時分別，相約之後在少林寺見。
第14集
牟滄浪掌管武當，不岐被其他師兄弟罵成叛徒，無量出來解圍，並勸說不岐配合自己。西門燕逼迫東方亮跟自己回去，東方亮不肯，兩人大打出手，西門燕敗下陣來，東方亮多方勸說，西門燕卻不依不饒，隨後劫持藍水靈離去。
第15集
藍玉京想用內功為巧兒療傷，但卻因體內沒有真氣未起到任何作用。巧兒因為發燒全身發冷直打哆嗦，藍玉京只好出去尋找柴火，回來時發現壹條毒蛇正對著巧兒虎視眈眈，藍玉京沖上去與毒蛇搏鬥咬傷了毒蛇，蛇血引發了他體內的紅丸之力。
第16集
東方亮同意和牟壹羽上少林，但他要求要光明正大地拜上山門，與少林僧人比劍。藍玉京和巧兒去少林寺拜會本無大師，本無大師以少林寺閉門謝客為由拒絕讓藍玉京入內。
第17集
圓通和慧可切磋武藝，兩人不分高下，方丈及時出手讓兩人點到為止。東方亮挑戰少林寺高僧失敗，只好在山下等藍玉京。圓通欲與藍玉京比試，藍玉京通過之前的觀摩，將四平拳融於自己的武當劍法中，受到了圓通的稱贊。
第18集
牟壹羽對東方亮說玉京早已不是當初那個傻傻的小子了，他現在身集武當少林兩大門派的秘籍法門，只要潛心修煉數年，必有大成。慧可給藍玉京講小五義的故事，玉京和巧兒都聽得入迷，山洞中玉京的功法劍譜意外被火燒光了，火光中顯現出幾排字來。
第19集
西門燕為感謝藍水靈的救命之恩，與藍水靈結為異姓姐妹。鄭巧兒和藍玉京隨慧可師父前往斷魂谷，途中他們被人下了迷藥並被關進了斷魂谷的地牢。
第20集
西門燕想讓藍水靈拜入西門夫人門下，但藍水靈認為這樣做是背棄師門，西門燕不以為然，她覺得既然藍水靈和她拜作了姐妹，就可以認西門夫人為幹娘，母女間傳授武功天經地義。東方亮扮成黑衣人下地牢與藍玉京比試劍法，當他得知藍玉京的飯菜被下藥氣憤不已，去找幫主理論。
第21集
東方亮向斷魂谷幫主說出實情，地牢裏的耿玉京三人並非是昆侖宮派來的，這壹切都是陸誌誠在挑撥昆侖宮和斷魂谷的關系。西門燕和藍水靈在趕往斷魂谷的路上，遇到了前來報信的斷魂谷三當家，眾人才知道是中了陸誌誠的奸計。
第22集
西門燕帶著耿玉京壹行人來到昆侖山死亡谷，為尋找七星劍，耿玉京決定壹人勇闖死亡谷。藍水靈擔心玉京的安危，於是和西門燕壹起去找東方亮來幫忙。牟壹羽帶人攻上了昆侖山，在壹位老前輩的協助下，玄武陣陣眼很快被破。
第23集
常五娘用言語激怒藍水靈，藍水靈與常五娘打鬥起來，常五娘不敵水靈敗下陣來，唐二出手攔住水靈帶著常五娘倉皇逃脫。黑衣人破了朱雀陣西門夫人不禁擔心起水靈和西門燕的安危，得知黑衣人帶著牟壹羽前往青龍橋，她決定去趟青龍橋，看看究竟是何人要徹底滅掉昆侖宮。
第24集
藍玉京向東方亮講述這壹路上的經歷，他與巧兒在昆侖山接受了壹番歷練，還拿到了七星劍，但想到慧可師父死在了黑衣人的手中不禁自責起來。巧兒安慰玉京，並表示要盡快查出真相不讓無辜的人枉死。
第25集
藍玉京向壹位老伯打聽耿京士的下落，老伯沒有聽說過耿京士，但他表示黑虎鎮地方不大找個人很容易，他邀請藍玉京結伴而行。東方亮生命垂危，在藍水靈的精心照顧下東方亮蘇醒過來，但很快又昏死了過去。
第26集
玉京在壹旁圍觀比武大賽，卻被場上的勇士點名要壹起比試比試，玉京憑借自己的武當劍法贏了比賽，並獲得了壹錠金子。藍水靈救了東方亮，東方亮表示自己來日必定舍命相報。
第27集
藍玉京決定私自放了新兵營裏的壯丁，蘇老伯趕來，他表示若是大軍統領得知新兵營遭劫，定會全力追捕在逃的壯丁，若此時回家無異於自投羅網，他提議將這些壯丁暫時收作府上的家丁保護起來。
第28集
雷大哥和雷大嫂帶著寨子裏的人趕來歡迎藍水靈，她們壹起載歌載舞非常開心。金閣主再次邀藍玉京加入淩雪閣，藍玉京沒有立即拒絕而是問了俸祿的事情，金閣主答應每月給他十兩，若是有功再加賞金。
第29集
鍛造隕鐵的事壹直沒有進展，東方亮和藍水靈想要幫忙，宋先生指出要鍛造這種隕鐵，必須找到壹種藥水才行。玉京被封為金鼎侍衛，專司護衛大汗之職，鄭爺爺告誡玉京要想取得努爾哈赤的信任，必須要處處謹慎，不可貪功冒進。
第30集
刺客已死但背後的指使者還沒有查出，詹王提議要穩定軍心，就要再攻下大明的壹座城池。東方亮在野外偶遇壹個老伯，沒想到竟然是自己失蹤的爹爹，但老伯已糊裏糊塗認不出東方亮了。
第31集
鄭鐵崗得知藍玉京將熊廷弼當成刺客抓捕了，他怒斥藍玉京太糊塗，因為在他看來熊廷弼可不是什麽刺客，而是大明最忠心耿耿的守將。得知熊廷弼的真實身份藍玉京很是自責，他被努爾哈赤所迷惑，只記得家仇卻忘了國恨，他決定與努爾哈赤決裂，營救熊廷弼。
第32集
藍水靈到處找都找不到東方亮，最後在山洞裏找到了昏迷不醒的東方亮。東方亮練劍入迷生出了很多白發，還不肯吃藥，藍水靈傷心地哭了起來。藍玉京和鄭巧兒根據鄭鐵崗留下的線索找到了同福藥鋪，順利與鄭鐵崗會合。
第33集
後金與大明的大戰壹觸即發，京師傳言，有金國密探混入，竊取密報，東廠、西廠更是借機鏟除異己。熊廷弼被東廠追殺，巧兒帶著熊廷弼先行壹步，卻不料熊廷弼最終被東廠的人抓走，巧兒也被打成重傷暈死過去。
第34集
巧兒不知所蹤，玉京大受打擊，整個人壹蹶不振。為了讓玉京能振作起來，西門燕帶著玉京前往荷月軒，玉京聽了苒苒的曲子內心的煩悶開解了不少。經過這次的事，玉京終於肯主動和西門燕出門了，西門燕帶著玉京放風箏，玉京在其中恍然悟出了道的真理。
第35集
藍玉京受傷倒地不起，義父想起玉燕臨終前的囑托，幫玉京擋了致命的壹掌。義父受了重傷，臨死前告訴玉京，他趁玉京父親不備之時偷襲了他，才會要了玉京父親的命。藍玉京將義父的遺體火化，並承諾要帶義父回武當，因為那裏才是他最想去的地方。
第36集
壹名黑衣人將藍玉京帶到郭璞的墓前，他身手十分敏捷，玉京猜測他肯定是個高手，黑衣人主動亮出自己的真實身份，原來他就是郭璞。玉京告訴郭璞他找回了七星劍，但七星劍被他的壹個已故的朋友巧兒帶走了，就在這時巧兒出現了，原來她只是腿部受了傷這段時間壹直在養傷，藍玉京和鄭巧兒約定以後再也不分開。
第37集
東方亮來到武當，準備救出藍水靈，誰知在與牟滄浪打鬥中強行運功導致走火入魔，藍水靈不忍心看著東方亮死在武當，拿自己的性命逼迫東方亮離開。金閣主帶著大隊人馬準備進攻武當山，而無量道長帶著東廠的人也在逼近武當山。
第38集
東方亮使用無刃古劍開啟了武當山的暗道，巧兒帶眾人進入了暗道，發現了武當山的軍械庫。東方亮通過修煉暗道中的武當劍法，功法精進。無量道長帶人追尋武當弟子來到叢林，林中遍布迷霧，無量命大家分頭搜尋，牟滄浪早有準備，在林中設下了埋伏。
第39集
金閣主等人妄圖毀掉武當山的金頂，武當山上壹場混戰開啟，東方亮打敗了無量，玉京殺死了金閣主。郭璞臨死前將七星劍托付給玉京，希望他能代自己把劍送回昆侖山。皇帝賜給武當太玄紫霄宮牌匾，以正視聽，將武當奉為大明國教。