第1期：滿城盡待牡丹開內容簡介：“跑男團”來到古都洛陽，以“牡丹”為背景完成壹系列的主題任務。新加盟的“小鮮肉”鹿晗初次登場就接到高難度任務，而且“跑男團”與洛陽市各行業代表壹起挑戰了“66人齊跳大繩”的吉尼斯世界紀錄。
分隊情況：
①仙童：鹿晗（Out）
②殺手：鄧超、Angelababy（楊穎）（Out）、李晨（Out）、陳赫（Out）、鄭愷、王祖藍（勝利）
（註：由於撕名牌環節仙童鹿晗失敗，為使牡丹花盛開之後環節轉為團隊合作戰） 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：無播出時間：2015-10-30拍攝地：河南洛陽第2期：勞動最光榮內容簡介：“跑男團”與“鋒味女神”馬蘇、“呆萌女神”陳喬恩、“豪爽女神”宋佳以及“靈動女神”郭采潔、“鮮肉女神”張慧雯壹同上演了壹場充滿懷舊氣息的又堪稱史上最強勁的“勞動特輯”。節目中，“跑男團”和“女神”們紛紛變身八十年代的勞動小能手，在“勞動最光榮職業技能大賽”中狂拼體力耐力。
分隊情況：
①紅隊：鄧超、Angelababy（楊穎）
②藍隊：李晨、陳喬恩
③綠隊：陳赫、宋佳
④紫隊：鄭愷、郭采潔
⑤黃隊：鹿晗、張慧雯（Out）
⑥粉隊：王祖藍、馬蘇（勝利） 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：宋佳、馬蘇、陳喬恩、郭采潔、張慧雯播出時間：2015-11-06拍攝地：河南洛陽第3期：偶像天團爭奪戰內容簡介：“跑男團”與“筷子兄弟”、蕭亞軒、吳莫愁分別組成兩大“音樂偶像天團”展開比拼，節目中，兩大“天團”就上演“寫名字”、“猜歌名”遊戲以及最後的演唱會比拼。
分隊情況：
①“Men in black”黑隊：鄧超、王祖藍、鹿晗、筷子兄弟、蕭亞軒（勝利）
②“壹片空白”白隊：Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、吳莫愁
（註：最終環節陳赫、王祖藍、王太利為評審，伊壹為主持人） 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：蕭亞軒、筷子兄弟（肖央、王太利）、吳莫愁、伊壹（主持）播出時間：2015-11-13拍攝地：廣東深圳第4期：利莫裏亞之戰內容簡介：實力偶像”的“跑男團”們搖身壹變，化身成了炫酷的“地球科學精英”，為了守護代表地球科技的芯片與變身“外星間諜”的利莫裏亞戰士王祖藍和謝娜展開了壹場鬥智鬥勇的追捕大戰。
分隊情況：
“地球科學精英”：鄧超（獲獎）、Angelababy（楊穎）、李晨（Out）、陳赫、鄭愷、鹿晗
“利莫裏亞戰士”：王祖藍（Out）、謝娜（獲獎）
（註：根據比賽規則”地球科學精英“獲得芯片即勝利，但由於謝娜因受多名地球人幫忙決定將送給首領的芯片歸還地球，鄧超與陳赫找到王祖藍，鄧超撕掉其名牌，最後謝娜與鄧超獲得了最終獎品） 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：謝娜播出時間：2015-11-20拍攝地：廣東深圳第5期：跑男西安美食榜內容簡介：“跑男團”和嘉賓黃渤、夏雨、林心如壹行人來到古城西安，找出西安特色美食。林心如上演了花式坑鄧超的好戲，而被指派了神秘任務的《鬼吹燈之尋龍訣》的主演黃渤和Angelababy，也將聯合挑戰跑男團的體力和智商。
分隊情況：
①黃隊：鄭愷（Out）、鹿晗（Out）
②綠隊：陳赫、王祖藍
③藍隊：鄧超（Out）、林心如（Out）
④粉隊：Angelababy（楊穎）（Out）、黃渤（Out）（勝利）
⑤橙隊：李晨（Out）、夏雨（Out）
（註：終極環節之前，粉隊擁有秘密任務，將其他人名牌撕掉並貼上且不被懷疑，可在撕名牌環節擁有強大優勢，其他人名牌變大，反之粉隊則獲得大名牌，但任務失敗，粉隊獲得大名牌。終極環節獲勝的綠隊沒有正確交換到西安美食榜第三名，最終粉隊獲勝） 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：黃渤、林心如、夏雨播出時間：2015-11-27拍攝地：陜西西安第6期：家族復興之戰（上）內容簡介：“跑男團”與嘉賓馮紹峰、Ella、柳巖組成的R家族，穿越回100年前，上演了壹場爆笑紛呈的“家族復興之戰”，R家族中分別有兩位繼承人和外族人，其他成員的任務是找出外族人並且保護繼承人，並上演了足球拍照群魔亂舞，兄弟缺點大揭秘等家族遊戲。
分隊情況：
①鄧超、②Angelababy（楊穎）（Out）、③李晨、④陳赫、⑤鄭愷、⑥王祖藍、⑦鹿晗、⑧馮紹峰、⑨Ella（陳嘉樺）、⑩柳巖
註：浙江衛視中國藍金靴獎得主張璇特別出演 固定主持：、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：馮紹峰、Ella（陳嘉樺）、柳巖播出時間：2015-12-04拍攝地：陜西西安第7期：家族復興之戰（下）內容簡介：“燒腦”升級“跑男團”大玩“推理遊戲”,真相撲朔迷離還沒解開，卻不斷有人被莫名淘汰，於是在本期“純燒腦特輯”中，各位“學霸”、“天才”、“技術帝”都覺得智商有點不夠用了。壹直自稱“學霸”的鄧超在節目中全程高度緊張，卻也玩出了“大烏龍”。而“技術帝”李晨在經過縝密分析看似看透了全局，但最終的結果卻讓人啼笑皆非。
分隊情況：
①外族人：陳赫（Out）、Ella（陳嘉樺）（Out）（可獲特權：使用慢性毒藥滴在物體上，觸碰到其物體的本家族人會被OUT。）
②繼承人：鄧超（勝利）、李晨（Out）（可獲特權：已知自己身份後，即使壹方繼承人被淘汰也可獨自使用鏡子獲取線索信息。）
③本族平民：Angelababy（楊穎）（Out）、鄭愷（Out）、王祖藍、鹿晗、馮紹峰、柳巖（Out）（勝利） 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：馮紹峰、Ella（陳嘉樺）、柳巖播出時間：2015-12-11拍攝地：陜西西安第8期：黑白天使之戰（保衛娘娘）內容簡介：“跑男團”和“娘娘”孫儷，也是《惡棍天使》中的查小刀。在南京展開壹場“黑白天使PK戰”，作為“白天使女王”的孫儷，是唯壹公布身份的人；“跑男團”中還有三位隱藏身份的“黑天使”和四位“白天使。“白天使“負責保護”女王“孫儷，黑天使則要在終極環節撕掉孫儷的名牌。
分隊情況：
①白天使：孫儷（女王）、Angelababy（楊穎）（Out）、李晨（Out）、王祖藍（Out）、鄭愷（勝利）
②黑天使：鄧超（Out）、陳赫（Out）、鹿晗（Out） 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：孫儷播出日期：2015-12-18拍攝地：江蘇南京第9期：跑男寶箱爭奪戰內容簡介：“跑男團”們與嘉賓楊冪壹起回到民國尋找價值連城的“海撈瓷”，並由此展開壹番怪異奇妙的經歷。之後又從民國穿越回現代，還玩起了前所未見的“身份穿越”，就是穿越後身份會互換，錯綜復雜的人物關系與千絲萬縷的劇情設定，讓節目變得更加撲朔迷離。
分隊情況：
①1942年（黑色名牌）：鄧超（Out）、Angelababy（楊穎）、李晨（Out）、陳赫（Out）、鄭愷（Out）、王祖藍（Out）、鹿晗（Out）、楊冪（Out）
②2015年（白色名牌）：鄧超（Out）、Angelababy（楊穎）（Out）、李晨（Out）、陳赫（勝利）、鄭愷（Out）、王祖藍（Out）、鹿晗（Out）、楊冪（Out）
註：“跑男團”與嘉賓從1942年穿越回2015年，除鄭愷外其余人發生身份互換。 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：楊冪播出日期：2015-12-25拍攝地：海南海口第10期：跑男挑戰節目組內容簡介：受夠了指壓板、泥潭、落水等各式“摧殘”的“跑男團”在第壹季“元老級跑男”王寶強的號召下直接向節目組示威抗議，想要來壹次“新年清算”，決定向欄目組發起挑戰，而面對“跑男團”們的抗議，制作組倒也不甘示弱，不但首度現身幕前正面回應，還精心設置了四輪遊戲讓”跑男團“們挑戰，獲勝越多，戰勝欄目組的可能性就越大，失敗壹方將面臨殘酷的跳水懲罰。
分隊情況：
①跑男團：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫（Out）、鄭愷（Out）、王祖藍（Out）、鹿晗（Out）、王寶強（Out）（勝利）
②制作組 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：王寶強播出日期：2016-01-01拍攝地：江蘇南京第11期：超模踢館跑男團內容簡介：“跑男團”再度開啟異國之旅，自韓國、塞班島之後又來到了澳大利亞墨爾本。異域美景自然少不了美人相伴，Angelababy、何穗、郭碧婷、張藍心、熊黛林、李亞男六大“女神”全都盛裝出席，令“跑男團”們尖叫不斷，大呼“驚艷”。節目中，“女神”們將與“跑男團”們壹起組隊爭奪“澳大利亞之星”的殊榮。
分隊情況：
①粉隊：鄭愷（Out）、熊黛林（第五代）（勝利）
②黃隊：李晨、郭碧婷（Out）（第三代）
③紫隊：王祖藍、李亞男（第壹代）
④綠隊：鹿晗、張藍心（第二代）
⑤紅隊：陳赫（Out）、何穗
⑥藍隊：鄧超、Angelababy（楊穎）（第四代）
註：遊戲三個小時，遊戲最後結束時獲得四張選票的隊伍成為最終的澳大利亞之星。伊壹、沈濤、羅希通過手機傳達遊戲任務。 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：熊黛林、郭碧婷、李亞男、張藍心、何穗播出日期：2016-01-08拍攝地：澳大利亞墨爾本第12期：最強者爭霸戰內容簡介：“跑男團”們來到澳大利亞阿德萊德，必須在街頭用節目組給到的初始道具壹顆咖啡豆挑戰“以物易物”，而最終決定勝負的是撕名牌大戰，本次再度上演“超能力撕名牌”。
分隊情況（個人賽）：只有撕掉他人名牌，升級為金色名牌的成員可以發動超能力。
鄧超（Out）異能學科：魔法高分子材料與工程學——限時三分鐘隱身。
Angelababy（楊穎）（Out）異能學科：魔法藥學——神魂顛倒球，被打中的人原地轉十圈大象鼻子。
李晨（Out）異能學科：魔法心理學——咒語：”到媽媽懷裏來“，召喚壹名玩家到自己身邊。
陳赫（Out）（勝利）異能學科：魔法醫學——使身體旋轉，將名牌移到胸前。
鄭愷（Out）異能學科：魔法數學——能和擁有金色名牌的人石頭剪刀布，贏了則使對方名牌降級，輸了無礙。
王祖藍（Out）異能學科：魔法物理學（至節目結束未使用超能力）
鹿晗（Out）異能學科：魔法機器人制造學——制造和自己相似的五個機器人幫助自己，即時生效。 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：無播出日期：2016-01-15拍攝地：澳大利亞阿德萊德 第1期：熱心觀眾同樂會 內容簡介：大年初壹，《奔跑吧兄弟》新春特輯中，“跑男團”與來自全國各地的70名《奔跑吧兄弟》熱心觀眾在海南三亞展開了壹場“熱心觀眾同樂會”，歡樂同聚的氣氛令不少網友大感“年味十足”，而各種團體遊戲洋溢出了正能量精神。
分隊情況：
①紅色學霸隊：鄧超、鄧秀琴、王曉燁、何麗、朱梓銘、國文超、劉欣源、潘靜、李琛、高曉海、竇珊珊
②黃色青春隊：Angelababy（楊穎）、苑振博、常露露、沈歡、佟偉寧、沈聰、劉強、項蓓蓓、江左、鄒瑩
③紫色最牛隊：李晨、鄭思佳、劉偉、王瑩瑩、韓筱、楊春蘭、奚安娜、錢嫻、楊光、陳慧玲、廖壹晶
④藍色天才隊：陳赫、崔詳洵、李政、胡偉松、安家寶、楊恬靜、楊春蘭、於濱、狄嘉倫、周遊、王佳祖
⑤橙色獵豹隊：鄭愷、漏喬波、姜尚宇、虢良、姜陽、梁霄、榮佳欣、陳嘉揚、鄭楚蕓、蘭跏雯、韓佩柔
⑥綠色完美隊：王祖藍、許超、李晨、田峰、劉峰、劉瑞思、朱哲楠、尤丹淇、謝偉嘉、茅宏、王歡
⑦粉色鮮肉隊：鹿晗、王可、思毅、陳俊帆、周莰皓、楊振濤、余夢佳、高丹蓉、王怡灑、周子熙（勝利）
註：每輪遊戲獲勝隊伍根據遊戲結果獲得不等數量的顏色球，在終極環節采用大樂透搖獎的形式決出最後的大獎屬於哪個隊伍。 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：熱心觀眾播出時間：2016年2月8日晚21:30拍攝地：海南三亞第2期：家族復興之戰（繼承者莊園燒腦版）內容簡介：懸念保留，抽絲剝繭揭秘繼承人外族人身份，“燒腦”程度全新升級。
分隊情況：
①外族人：陳赫（Out）、Ella（陳嘉樺）（Out）（可獲特權：使用慢性毒藥滴在物體上，觸碰到其物體的本家族人會被OUT。）
②繼承人：鄧超（勝利）、李晨（Out）（可獲特權：已知自己身份後，即使壹方繼承人被淘汰也可獨自使用鏡子獲取線索信息。）
③本族平民：Angelababy（楊穎）（Out）、鄭愷（Out）、王祖藍、鹿晗、馮紹峰、柳巖（Out）（勝利）
註：本期與正片第七期最大區別為：直到遊戲最後才公布外族人。 固定主持：鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍、鹿晗節目嘉賓：馮紹峰、柳巖、Ella（陳嘉樺）播出時間：2016年2月9日晚21:30拍攝地：陜西西安第3期：《奔跑吧兄弟第三季》第8期（黑白天使之戰）播出時間：2016年2月10日晚21:30第4期：《奔跑吧兄弟第三季》第2期（勞動最光榮）播出時間：2016年2月11日晚21:30 特殊名牌
名牌名稱期數持有者說明環節殺手身份名牌第壹期鄧超、Angelababy（楊穎）、李晨、陳赫、鄭愷、王祖藍“殺手”要“殺”掉“仙童”（鹿晗），除掉牡丹。第壹環節：保衛牡丹（鹿晗VS其他六人）