1.信息工程學院
信息工程學院成立於1994，有20多年的歷史。目前學院有計算機科學與技術、軟件技術、物聯網技術等幾個專業。
2.機電工程學院
機電工程學院創建於1986，是廣東省重點建設院校之壹。學院下設航空電子技術、自動化技術應用等專業，涵蓋航空電子、機電壹體化等方向。
3.飛行學院
飛行學院成立於1979，是學校最早成立的學院之壹。學院自成立以來始終致力於培養民航專業人才，擁有多個國家級教學團隊和實訓基地，深受學生和企業的認可。
4.管理學院
管理學院成立於2002年，是學校新成立的院系之壹。目前學院擁有旅遊管理、市場營銷、物流管理等多個專業，構建了覆蓋物流全產業鏈的課程體系。
5.航空服務學院
航空服務學院成立於2008年。目前開設有航空服務與管理、航空安全與風險控制、旅遊英語等專業，為學生提供了廣闊的發展平臺和就業機會。
6.國際經濟與貿易學院
國際經濟與貿易學院成立於2013，旨在培養具有國際視野和全球思維的人才。該學院有國際經濟與貿易、對外漢語教學和經濟管理等專業。
綜上所述，廣州民航職業技術學院是壹所設有多個院系的實用型高職院校，均以培養實用型民航技術人才為目標，為學生提供了廣泛而深入的教育培訓平臺。