在大廳的中央，有等候座位。從南到北分為京津城際、京滬高速、普速列車三大區域，共5000個座位。整個大廳可容納壹萬多名乘客同時候車。到達南站動車組候車大廳的途徑有:1，從南廣場公交樞紐直接進入主站樓壹樓，再乘電梯進入二樓候車大廳；2.地鐵4號線北京南站下車，乘扶梯到二樓候車大廳。