在豐臣統治時期二本松城曾經成為蒲生氏鄉、上杉景勝、蒲生秀行及蒲生忠鄉管治下的壹座支城。1627年蒲生忠鄉病逝，在無子繼承下，由加藤嘉明入藩管治。嘉明的外婿松下重綱封被到二本松城，重綱同年身亡由長子長綱。壹年後，加藤明利入主，直至1643年被改易為止。
1643年10月1日，丹羽光重入藩，直到廢藩置縣為止，仍由丹羽氏管治。