2008年4月16日：副都心線開始試運行。
2008年6月13日：通車前在新宿三丁目站舉行開通紀念儀式。 2008年6月14日：副都心線池袋站－澀谷站通車，全線開業，有樂町線新線被合並，並開始與東武東上線、西武池袋線的貫通運營。
2008年6月16日：由於職員對機器操作不熟悉，8輛、10輛編組車輛混行，早高峰期間在節點小竹向原站發生的混亂導致副都心線、有樂町線及貫通線路大面積晚點。晚些時間，東新宿站發生各站停車列車進入急行通過線的事故。混亂被媒體廣泛報道。
2010年3月6日：明治神宮前站增加副名稱〈原宿〉，休息日的急行列車加停明治神宮前〈原宿〉站。
2010年10月16日：冰川臺站－地下鐵成增站月臺安全門安裝完畢。
2011年2月23日：冰川臺站－地下鐵成增站、小竹向原站B線啟用發車提示音樂。
2013年3月16日：地下鐵副都心線、有樂町線、西武有樂町線、、東橫線、港未來線東武東上線實現相互直通運轉。