1、缺鈣硫等微量元素
當人體缺鈣時，指甲的生長會受到影響，容易凹陷下去；人體中腳趾甲（指甲）是含硫最高的部位之壹，是多種蛋白質、酶的中藥組成部分，機體硫元素含量不足的情況下，腳趾甲（指甲）都會顯得不健康，指甲凹陷也是癥狀之壹。
2、缺蛋白質等營養物質
腳趾甲中蛋白質的含量達97%以上，腳趾甲相當於皮膚的外延，從根部生長出的腳趾甲逐漸角質化，成為我們日常看見的樣子，當蛋白質缺乏時，腳趾甲就會出現“營養不良”的癥狀，微微凹陷下去。
3、缺鐵性貧血
缺鐵性貧血的人也有腳趾甲凹陷的現象，血液中鐵元素影響血紅蛋白的合成，最終會造成年人體各組織、各細胞供氧不足，而腳趾甲又是在人體末端，缺鐵的癥狀更加明顯，所以這也是腳趾甲凹陷原因之壹。
4、真菌感染
常見的關於腳趾甲的真菌感染疾病是灰指甲，中醫稱之為“鵝爪風”，這種疾病的腳趾甲尖端會翹起，看起來會有些凹陷，其他癥狀有指甲增厚變黃，這兩點更加明顯。
5、腳趾甲凹陷怎麽辦
腳趾甲凹陷還有其他可能原因，前面說的只是較為常見，如果腳趾甲凹陷了該怎麽辦呢。
1、可以多吃壹些富含硫、鈣等微量元素的食物，比如牛奶、薺菜、黑豆、豬肉、豬肝等
2、多吃些富含鐵的食物，比如紅棗、菠菜、芹菜、蘋果等。
3、補充適量人體所需蛋白質，比如禽蛋類、肉類、大豆、豆制品等
4、如果是真菌感染或是其他疾病引起宜就醫確診，對癥治療。
6、腳趾甲變厚發黃原因
考慮是真菌感染引起的灰指甲。真菌壹旦侵入甲板與甲床的縫隙，就會在裏面大量繁殖，明顯地影響指甲的外觀。使得腳趾甲呈堆狀隆起，導致腳趾甲增厚，內部有粉屑沈積。還會掩蓋甲床本身自然的粉紅色，使得甲板不再透明。