入藥部分種子入藥。
采集加工夏季果實成熟時采收植株，曬幹，打下種子，除去雜質，曬幹備用。中藥生用或炒用。蒙藥生用。
藥村鑒別性狀種子呈扁卵形，長l～1.5毫米，寬0.5～l毫米，表面棕色或紅棕色，微有光澤，具縱溝2條，其中l條較明顯。壹端鈍圓，另壹端尖而微凹，類白色，種臍位於凹入端。無臭，味微辛辣，黏性較強。鑒別：(1)取本品少量，加水浸泡後，用擴大鏡觀察，透明狀黏液層較厚，厚度可超過種子寬度的1/2以上。(2)本品種皮表面觀：下皮細胞多角形，少數長多角形直徑15～42微米，壁厚5—8微米。
化學成分種子含脂肪油，芥子甙，蛋白質，糖類等。尚分出兩種強心甙，其壹名為七裏香甙甲。還有白芥子甙，異硫氰酸芐酯。
藥理作用獨行菜種子具強心作用，在貓的心肺置備實驗中，對水合氯醛形成的衰弱心臟，能使其收縮力加強，輸出量增加，血壓隨之輕度升高，靜脈壓下降；種子醇提物在體心臟(蛙、兔、貓)，貓心電圖描記及心肺制備標本實驗中，均有強心甙樣的作用，大劑量可引起心動過速，心室顫動等強心甙中毒癥狀。臨床用於治療慢性肺原性心臟病並發心力衰竭。鴿靜脈註射最小致死量為4.36克/千克，另外本品具有平喘及利尿作用。
性味功能中藥味苦、辛，性大寒。瀉肺平喘，祛痰止咳，行水消腫。蒙藥味辛、苦，性涼、鈍、稀、輕、糙。止咳，祛痰，平喘，清熱，解毒。
主治中藥治痰涎壅肺，咳嗽喘促，胸脅脹滿，肺癰，胸腹積水，水腫，小便不利，肺心病。蒙藥治喘咳，肺感，搏熱，臟熱，毒熱，“協日”熱，血熱，肺心病。
用量用法中藥3～10克，水煎服，或入丸散劑。蒙藥多配方用。
使用註意肺虛喘咳及脾虛腫滿者忌用。
藥方配制
慢性滲出性胸膜炎：獨行菜種子（炒）15克，紅棗4枚，獲婁9克，半夏6克，甘草3克，水煎服。
老年慢性支氣管炎，喘息咳嗽：獨行菜種子9克，杏仁9克，陳皮6克，桑白皮9克，水煎服。