1．種子采集。7月末至9月末初采集飽滿種子，將采下來的種子放在陰涼地方涼幹貯藏。
2．種子處理。當溫度降到-15℃以下時，先用清水浸泡種子24小時左右，然後混沙冷藏（細河沙與種子比例為1：1），第二年春季3月末4月初取出種子進行催芽，溫度控制在10～20℃，當約有30%左右種子露芽時即可播種。
3．選地及整地。最好選擇土質疏松的沙壤土，整好地施足底肥，每畝施發酵好的豬糞2000～3000公斤。
4．播種。4月中旬當土壤化凍後，開始做床，床做好後澆足底水，第二天開始播種，播種時在床面上摟小溝，溝距20厘米，溝深1～1.5 厘米，將混有沙子的種子均勻撒播在溝內，每畝用混沙的種子約30公斤，播後覆上1厘米厚細土，然後再蓋壹層稻草，有保持床面濕度。
5．田間管理。水芹出苗持續時間約20～25天，須在播種後保持床面濕潤，如遇天旱，床面要及時澆水。當有80%水芹出苗露土後，在傍晚日落後揭開覆蓋的稻草。揭開覆蓋的稻草後要及時搭建遮陰網架，並用單層黑色遮陰網進行覆蓋遮陰，高度不低於2.5 米，兩側不低於1.5米。以後田間管理主要是控制雜草，每隔10～15天進行壹次除草，不能造成草荒，除草應避免用化學除草劑。