1，DHA含量不同。
藻油DHA:藻類DHA含量高，幾乎沒有EPA。如果DHA是從藻類中提取的，那麽DHA和EPA的比例是20:1。
魚油DHA:如果是從魚油中提取的，DHA和EPA的比例是(4 ~ 5): 1。
2.不同的特點
海藻油DHA:從海藻中提取的DHA，純天然，植物性，抗氧化能力強。
魚油DHA:從深海魚油中提取的DHA具有活性，容易氧化變性。
二、選擇:海藻油DHA更適合嬰幼兒。
海藻油中提取的DHA最有利於嬰兒的吸收，能有效促進嬰兒視網膜和大腦的發育。請選擇海藻DHA，因為學術界也壹致認為海藻油DHA更適合嬰幼兒。
EPA可以降血脂，稀釋血液，所以從深海魚油中提取的DHA和EPA對老年人和成年人都有好處。
擴展數據
從魚油中獲取DHA存在壹些問題:
1)魚油提取的DHA膽固醇含量高，有腥味，嚴重影響DHA的質量；
2)不同種類的魚魚油中的DHA含量不同，魚油中的DHA含量會因季節、地理位置、捕撈時間等條件的不同而不同；
3)從魚油中提取DHA的過程中，由於氫化降低了魚油中DHA的收率，造成了DHA的浪費；？
4)魚油中的DHA含有大量其他飽和及低不飽和脂肪酸，難以濃縮，導致加工復雜，從而增加了DHA生產的成本；
5)魚油提取的DHA不適合素食者。此外，大量有機汙染物在魚脂肪中積累。
百度百科-DHA海藻油