菠蘿黑心病病因目前還不是很明確，但大多數學者認為是由低溫引起的生理失調癥，22~25℃以下的低溫可導致該病，高於25℃則不發生。國外有學者認為菠蘿對黑心病的敏感性始於田間，而收獲後的環境只是加強了這種敏感性。田間低溫可能引起代謝的某些變化，產生壹種導致黑心的前體物(Precursor)，收獲後繼以低溫(4~8℃)貯運，促使前體物累積。若接著在20℃高溫下7天，前體物會轉變成毒物，導致黑心。但如果再繼續在低溫下貯藏，前體物又會停止合成並轉變為無毒的化合物。這種毒物，可能是褐色的酚鹽化合物。我國譚興傑等(1989)認為誘導菠蘿黑心病的因子，除低溫外，還有赤黴素(GA3)。
防治方法：
（1）選用抗耐病品種。目前種植的品種不多，耐病品種更少。唯南園五號是抗性較好的鮮食種，但果形稍小，有壹定的推廣難度。
（2）栽培防治。合理施肥，:施足基肥,以土雜肥為主,增施磷鉀肥,控制氮肥用量,常用氮、磷、鉀比例為3∶1∶2。追肥要早,避免在成果期集中施用；嚴格控制赤黴素和萘乙酸在催果時的使用濃度；在果實增大期，適當追施壹些氯化鈣等鈣質肥。
（3）適當采收，及時加工。（4）科學貯運。