1.胃腸道手術後的病人。胃大部分切除手術後短期內不適合喝酸奶，因為病人失去了加工食糜的能力，如果進食富含營養的流質、半流質食物,這些食物會很快進入小腸，引起空腸膨脹，病人旋即會出現嘔吐、痙攣、腹瀉、頭暈和極度虛弱的情況。
2.腹瀉或其他腸道疾病患者。本來對奶制品消化吸收良好的人，腸道損傷後，體內會失去絕大部分乳糖酶，從而出現乳糖不耐受的情況，加重腹瀉。雖然酸奶經過乳酸菌的發酵，但其中的乳糖成分還會殘留50%左右。
3.牛奶過敏者。有些人對牛奶、雞蛋等食物中的某些蛋白質成分過敏，出現絞痛、嘔吐、暴躁、呼吸困難或皮膚過敏反應(常為濕疹)甚至休克。也有些嬰兒的牛奶過敏癥表現為貧血，這是因為攝入牛奶後引起不明顯的腸道出血，往往出血幾個月後才引起家長註意。因此，對牛奶過敏的人也往往不適合喝酸奶。
4.糖尿病人。酸奶在制作過程中會添加蔗糖作為發酵促進劑，有時還會用各種糖漿調味，所以糖尿病人在選擇酸奶的時候要特別註意：只有那些用代糖品制作的無糖酸奶才可以選用，並要遵從營養醫師的推薦量。