主條目：利瑪竇規矩
參見：中國禮儀之爭、耶穌會及道明會
利瑪竇容許中國教徒繼續傳統的祭天、祭祖、祭孔。利瑪竇主張以“天主”稱呼天主教的“神”（拉丁文的Deus）；他認為中國傳統的“天”和“上帝”本質上與天主教所說的“唯壹真神”並無分別。而祭祀祖先與孔子，這些只屬追思先人與緬懷哲人的儀式，與信仰並無什麽幹涉；只要不摻入許願、崇拜、祈禱等成分，本質上並沒有違反天主教教義。利瑪竇的傳教策略和方式，壹直為之後到中國傳教的耶穌會士所遵從，是為“利瑪竇規矩”
康熙時代，道明會傳教士為了排擠耶穌會傳教士在中國傳教，向教皇申訴利瑪竇等人允許中國教徒崇拜祖先，違背了天主教教義。道明會傳教士建議教皇派特使到中國晉見康熙帝，要求更改利瑪竇規矩以排除容許中國傳統的傳教方式, 和康熙爭辯。康熙認為“不可理喻”，強令傳教士遵從，否則逐回。此即中國禮儀之爭事件。而祭祖敬孔的禁令直到數百年後的1939年12月8日由教宗碧嶽十二世（即庇護十二世）廢除，這也側面顯示出了利瑪竇對中國文化的了解。