蜂蜜的質量與結晶無關，主要與溫度有關。溫度高時，蜂蜜不會結晶，溫度低時，蜂蜜就會結晶。同時，只有棗蜜、洋槐蜜等少數蜂蜜品種不易結晶，其他大部分蜂蜜容易結晶(處理後除外)。喝蜂蜜的時候，蜂蜜最好是無定形的狀態，結晶的蜂蜜不適合喝。有必要在飲用前將無定形的蜂蜜還原。
如果要判斷蜂蜜的好壞，可以通過外觀來判斷。壹般純蜂蜜呈黃白色，細膩柔軟；假蜜糖晶體粗糙透明。無定形的時候看顏色，真蜂蜜的顏色是透明或半透明的。
如何保存弱酸性的蜂蜜，當它與金屬接觸時，很容易使蜂蜜變色變黑，其營養價值也會被破壞。所以蜂蜜不能存放在金屬容器中，而是放在非金屬容器中，如陶瓷、玻璃瓶、無毒塑料桶等，最好是廣口的。
蜂蜜有從空氣中吸收水分的能力。蜂蜜吸收的水分過多會降低濃度，容易導致發酵變質。所以蜂蜜的儲存要蓋緊，防止漏氣，減少與空氣的接觸，可以使蜂蜜保存的時間更長。蜂蜜的適量是容器的80%。每次吃完蜂蜜後把容器蓋好，防止汙染。