巴氏鮮奶的優勢在於營養價值高，含鈣量高。因為巴氏殺菌主要是在低溫下進行，完全保留了鮮奶本身的價值，使其營養結構盡可能不被破壞。相應的，由於其采用的化學殺菌方式，也會帶來壹些不良影響。原來的鮮奶會混入化學上不能分解的物質，對人體不好。所以巴氏鮮奶有好有壞。
巴氏鮮奶主要是用化學物質殺菌，也會帶來新的物質。所以這樣做出來的牛奶不宜保存太久，要當天食用。因為低溫殺菌，原有的營養價值得到很好的保護，營養豐富。經過特殊工藝脫水制成粉末的奶粉，可以長期保存，但營養價值相對較低。
喝巴氏鮮奶要因人而異。有些人會因飲用巴氏殺菌鮮奶而受益，有些人甚至會過敏。所以，並不是說這個鮮奶就壹定好，牛奶沒有好壞之分。只能說適合不適合，因為人的功能不壹樣。