1、制作工藝。柑橘蜜是蜜蜂采集柑橘花釀制而成，而蜂巢蜜使蜂蜜築巢後，蜜蜂在蜂巢內將蜂蜜釀制成熟並封上蠟蓋形成蜜脾，未經人為加工，不易摻雜做假和汙染可以直接食用的蜂蜜產品，蜂巢蜜營養成分更高，所以蜂巢蜜好。
2、功能。柑橘蜜在加工時溫度不當使得蜂蜜中最主要的活性物質酶類被滅活或蜂蜜存放時間過長，酶類物質活性降低，而蜂巢蜜含有豐富的生物酶、維生素、多種微量元素、蜂膠、蜂蠟、蛋白質、遊離氨基酸、遊離脂肪酸和核酸類等化合物為蜜中之極品，加之含有粉花粉，具有極高的人體保健價值，所以蜂巢蜜好。