1.外觀區別:蕎麥和黑苦蕎外觀不同。蕎麥種子小，灰褐色，三角形，粒面光滑有光澤；黑苦蕎的種子顏色較深，形狀不規則，粗糙無光澤。
2.用途不同:蕎麥和黑苦蕎都可以用來制作食品，只是用途略有不同。蕎麥壹般用來磨成面粉，做成蕎麥面、餃子皮等烘焙食品。黑苦蕎用於制作飲料，如苦蕎酒或醋。
3.營養不同:蕎麥和黑苦蕎的營養也不同。蕎麥含有豐富的礦物質和維生素B族，以及膳食纖維和蛋白質，有助於調節血糖和膽固醇。而黑苦蕎含有較多的苦蕎酮，被認為對心血管疾病和糖尿病有壹定的預防作用。
4.生長環境不同:蕎麥和黑苦蕎的生長環境也不同。蕎麥壹般生長在氣候寒冷、海拔高的地區，如雲貴高原、西藏等。黑苦蕎更適合生長在溫帶或寒冷氣候，如黑龍江、吉林等地。