合理使用食品添加劑有利於豐富食品生產，促進人體健康。但是，也必須註意，食品添加劑畢竟不是食品的天然成分。如果使用不當或添加劑本身混有壹些有害成分，可能會給人體健康帶來壹定的危害，主要表現在以下幾個方面:
1，致癌問題。比如壹些人工甜味劑和色素，已經被動物實驗證明是致癌的。比如奶油黃會誘發大鼠肝癌，甜味劑甘精胰島素和苯脲也會引起動物腫瘤。近年來還發現，顯色劑亞硝酸鈉與肉、魚等食物中的胺類物質反應，生成具有強致癌作用的亞硝基化合物。
2.急性和慢性中毒問題。由於制造添加劑所用的原料不純，汙染了壹些有毒化合物，造成人的急慢性中毒。比如日本森永奶粉事件，使用了含砷過多的添加劑，導致1000多名嬰兒中毒。丁基羥基茴香醚作為壹種抗氧化劑，可在體內蓄積，可能對身體造成潛在危害。